La maggior parte delle reliquie di Sainte-Geneviève furono bruciate pubblicamente durante la Rivoluzione francese, ma alcuni piccoli pezzi sopravvissuti, così come la roccia su cui poggiava la sua tomba, sono conservati a St-Étienne-du-Mont.
La chiesa stessa sulla Montagne Sainte-Geneviève iniziò a essere costruita nel 1517 e fu completata nel 1627. Nella chiesa si trovano anche le tombe di Blaise Pascal e Jean Racine. Jean-Paul Marat fu sepolto in uno dei due cimiteri della chiesa, anche se nessuno dei due esiste ora.
Dopo la Rivoluzione Francese, la chiesa fu trasformata, come il vicino Pantheon, in un santuario della ragione, chiamato "Tempio della pietà filiale". Fu anche in questo periodo che furono distrutte le reliquie di Santa Geneviève, patrona di Parigi. Ciò che è stato salvato si trova in una piccola cappella della chiesa ridedicata, compresa la sua lapide circondata da un reticolo d'oro e alcuni resti minori della santa custoditi in un cilindro di vetro.
Le sue reliquie sono molto rare, poiché il suo corpo fu bruciato dai rivoluzionari nel 1793. Ce n'è una molto piccola che è permanentemente dietro la sua tomba, ma non è facilmente accessibile. Quello grande, che si trova in un reliquiario portatile, accanto all'altare maggiore, proviene dal tesoro di Notre-Dame de Paris e viene "prestato" ogni anno a Saint-Etienne du Mont. È la reliquia che si trovava a Sainte-Geneviève-des-Bois e che fu depositata a Notre-Dame dopo la Rivoluzione, dopo essere stata "riconosciuta" da un vescovo, che era in carica prima della Rivoluzione. Durante la "novena" di Santa Geneviève, ogni giorno si celebrano due messe, una alle 15:00 e un'altra alle 18:45, spesso presiedute dai vescovi: al termine di ogni messa ci si può avvicinare per venerare la grande reliquia e fottila.
La scala a doppia chiocciola con sovrastante soffitta è detta jube. Si tratta di un tipo di tramezzo che in origine separava i laici dall'altare maggiore. Questo fu installato nel 1530 e creato da Biart le Père. La maggior parte dei tramezzi furono rimossi durante la Controriforma o dopo il Vaticano II. Questo è l'unico esempio sopravvissuto a Parigi.
