El 17 de mayo de 1306, el cráneo de San Luis fue colocado en un suntuoso relicario en forma de cabeza y trasladado de la abadía de Saint Denis a la Sainte Chapelle. A partir de entonces, Philippe le Bel y sus sucesores distribuyeron generosamente las reliquias de su antepasado. El esqueleto del piadoso Luis IX eventualmente se reduciría en múltiples fragmentos, que serían dispersos y en su mayor parte destruidos durante la Revolución.
El 25 de agosto de 1298, día de San Luis, Philippe le Bel hizo levantar el cuerpo de su ilustre abuelo en Saint Denis: los huesos fueron colocados en un santuario dorado, instalado detrás del altar mayor de la basílica. El 17 de mayo de 1306, el cráneo de Luis IX fue colocado en un suntuoso relicario y trasladado a la Sainte Chapelle. En esta ocasión, el rey donó una costilla de su antepasado a la catedral de Notre Dame.
Los monjes de Saint Denis, responsables del resto del esqueleto, lucharon duramente para preservar la mandíbula inferior, para lo cual hicieron construir un magnífico relicario, que fue inaugurado solemnemente el 25 de agosto del año siguiente. A partir de entonces, Philippe le Bel y sus sucesores distribuyeron y esparcieron generosamente las preciosas reliquias de San Luis.
Desde la Alta Edad Media, las reliquias (de la palabra latina reliquiae, que significa "restos") de los santos han sido objeto de un culto especialmente ferviente. Miles de peregrinos vienen a admirarlas o tocarlas para beneficiarse de sus milagros, son sobre todo una extraordinaria fuente de riqueza para las iglesias y abadías que las albergan. Muerto al servicio de Dios, incluso como mártir, Luis IX fue canonizado por el Papa Bonifacio VIII el 6 de agosto de 1297, por lo que resulta particularmente beneficioso, o lucrativo, tener incluso el fragmento de un hueso de este santo entre todos los santos.
De los últimos Capetos, el rey de Noruega Haakon Magnuson recibe las falanges de San Luis, destinadas a la iglesia de la isla de Tysoën, cerca de Bergen. Al igual que los monjes benedictinos de París y Reims, las abadías de Royaumont y Poissy también están dotadas de reliquias. Alrededor de 1335, la reina Blanca de Suecia obtuvo fragmentos de huesos para el monasterio de Santa Brígida en Vadstena, cerca de Estocolmo. En 1378, el emperador Carlos IV obtuvo el mismo privilegio para la catedral de Praga.
En 1392, en Saint Denis, los huesos de San Luis fueron colocados con gran pompa en un nuevo santuario. Con motivo de esta ceremonia, Carlos VI ofreció una costa al Papa Bonifacio IX e hizo el mismo regalo a sus tíos, el duque Juan de Berry y el duque de Borgoña, Felipe III el Temerario. Para su mayor alegría, los prelados presentes fueron recompensados con un hueso, que sin embargo tuvieron que compartir.
Durante los siglos siguientes continuó la dispersión de los restos del piadoso Capeto. En 1430, el duque Luis VII de Baviera recibió un hueso para su iglesia de Ingolstadt, cerca de Munich. En septiembre de 1610, la reina madre María de Medici también obtuvo uno, que devolvió a la abadía de Saint Denis el mes siguiente durante las ceremonias de coronación del joven Luis XIII.
En 1616, a Ana de Austria se le concedió un trozo de costa: juzgando que era muy poco teniendo en cuenta su condición de Reina de Francia, consiguió obtener una costa entera al año siguiente. También está trabajando para que se atribuyan otra costilla y un hueso del brazo a los jesuitas de París y Roma respectivamente.
Hoy en día, prácticamente no queda nada del esqueleto del santo rey. El relicario de la cabeza de San Luis, encargado en 1306 por Philippe le Bel, fue fundido durante la época revolucionaria, probablemente al mismo tiempo que se destruía el cráneo; Sin duda tomado en esta época como muestra, sólo una pequeña lámina de esmalte se conserva en el gabinete de Medallas de la Biblioteca Nacional desde 1796.
El santuario de 1392 fue destruido, al igual que su contenido. La mandíbula inferior y una costilla se exhiben en la Catedral de Notre Dame; y en 1926, el Arzobispo de París donó un pedazo de esta costa a la Iglesia de San Luis en Montreal, Canadá. En cuanto al hueso presentado a Saint Denis, en la capilla absidal de la Virgen, su origen sigue siendo un misterio.
